מערכת המשפט לא רק באה להגן על החברה על מנת שלא יהיה מצב שבו איש את רעהו חיים בלעו, אלא כל אחד לומד משפטים כי זה חלק מהותי מדברי התורה שלנו. הרב ישי סמואל מעורר את תלמידי הישיבה לחשיבות התפילה על השבת שופטינו כבראשונה ויועצינו כבתחילה.

פרשת משפטים נפתחת בהלכה על עבד עברי, שעלולה להיראות בעיני אנשים רבים כאנאכרוניסטית ולא מודרנית.  היינו מצפים שיפתחו את הפרשה הזאת באיזה כלל או חוק שמתווה דרך עקרונית ומעניק לנו את המכנה המשותף לכל הפרטים של הפרשה הזאת. אבל הפרשה שלנו נפתחת ב"כי תקנה עבד עברי". במבט ראשון נראה שהדין הזה פחות שייך לעולם שלנו. העולם כבר התקדם מאז הימים שבהם עבדות היתה נפוצה. עברנו כבר את מרטין לותר קינג ואת המאבק נגד האפרטהייד ואפילו היה נשיא שחור בארצות הברית, אז למה פרשת משפטים פותחת בענייני העבדים?

הרב צבי יהודה קבע כלל פרשני על פרשיות התורה, אותו הוא מיישם בכל התורה כולה. הכלל הזה הוא "כלל הזוגיות". על פי כלל זה, מוצא הרב צבי יהודה הקשרים רוחניים ומהותיים מאוד בין כל צמד מפרשות התורה. זהו מבנה שיטתי של הרב צבי יהודה השזור במהלך כל התורה, חידוש יצירתי ומקורי בהבנה הפרשנית של פרשיות התורה וכן בהבנה הרוחנית של הדברים.